MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Azospirillum brasilense Sp245 plasmid AZOBR_p2

Total Repeats: 25658

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016618	T	6	6	13	18	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016618	T	6	6	88	93	0 %	100 %	0 %	0 %	392383674
3	NC_016618	GCCG	2	8	94	101	0 %	0 %	50 %	50 %	392383674
4	NC_016618	T	8	8	102	109	0 %	100 %	0 %	0 %	392383674
5	NC_016618	C	8	8	164	171	0 %	0 %	0 %	100 %	392383674
6	NC_016618	TC	3	6	228	233	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_016618	CGG	2	6	304	309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_016618	CCCG	2	8	386	393	0 %	0 %	25 %	75 %	392383675
9	NC_016618	CGC	3	9	406	414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392383675
10	NC_016618	GAC	2	6	422	427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392383675
11	NC_016618	TGGG	2	8	441	448	0 %	25 %	75 %	0 %	392383675
12	NC_016618	TCC	2	6	519	524	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392383675
13	NC_016618	CCGG	2	8	546	553	0 %	0 %	50 %	50 %	392383675
14	NC_016618	CGT	2	6	574	579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392383675
15	NC_016618	TCC	2	6	642	647	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392383675
16	NC_016618	TGGT	2	8	651	658	0 %	50 %	50 %	0 %	392383675
17	NC_016618	ACC	2	6	696	701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392383675
18	NC_016618	CTT	2	6	743	748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392383675
19	NC_016618	CG	3	6	937	942	0 %	0 %	50 %	50 %	392383675
20	NC_016618	CAG	2	6	959	964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392383675
21	NC_016618	GCC	2	6	981	986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392383675
22	NC_016618	CGC	2	6	1046	1051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392383675
23	NC_016618	CGA	2	6	1057	1062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392383675
24	NC_016618	CCG	2	6	1068	1073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392383675
25	NC_016618	CG	3	6	1122	1127	0 %	0 %	50 %	50 %	392383675
26	NC_016618	GCC	2	6	1141	1146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392383675
27	NC_016618	CGGA	2	8	1160	1167	25 %	0 %	50 %	25 %	392383675
28	NC_016618	GGGT	2	8	1173	1180	0 %	25 %	75 %	0 %	392383675
29	NC_016618	CTC	2	6	1196	1201	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392383675
30	NC_016618	CCGA	2	8	1248	1255	25 %	0 %	25 %	50 %	392383675
31	NC_016618	GCC	2	6	1289	1294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392383675
32	NC_016618	GATGCC	2	12	1382	1393	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	392383675
33	NC_016618	TCT	2	6	1525	1530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392383675
34	NC_016618	CGT	3	9	1585	1593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392383675
35	NC_016618	CCG	2	6	1603	1608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392383675
36	NC_016618	CTC	2	6	1640	1645	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392383675
37	NC_016618	TGA	2	6	1684	1689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392383675
38	NC_016618	GCG	2	6	1714	1719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392383675
39	NC_016618	GAGGAA	2	12	1754	1765	50 %	0 %	50 %	0 %	392383675
40	NC_016618	GTG	2	6	1785	1790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392383675
41	NC_016618	GCG	2	6	1792	1797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392383675
42	NC_016618	TCG	2	6	1827	1832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392383675
43	NC_016618	CGA	2	6	1894	1899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392383675
44	NC_016618	CGA	2	6	1981	1986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392383675
45	NC_016618	CGT	2	6	1993	1998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392383675
46	NC_016618	CG	3	6	2011	2016	0 %	0 %	50 %	50 %	392383675
47	NC_016618	TCT	3	9	2043	2051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_016618	AAC	2	6	2068	2073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_016618	ACA	2	6	2087	2092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_016618	TGC	2	6	2132	2137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_016618	CCCG	2	8	2138	2145	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
52	NC_016618	AAC	2	6	2146	2151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_016618	GCC	2	6	2163	2168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_016618	GCC	2	6	2172	2177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_016618	ACC	2	6	2181	2186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_016618	AGA	2	6	2194	2199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016618	GC	3	6	2218	2223	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_016618	GCC	2	6	2331	2336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_016618	C	6	6	2335	2340	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
60	NC_016618	CCGC	2	8	2342	2349	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
61	NC_016618	CAG	2	6	2394	2399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_016618	CGT	2	6	2408	2413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_016618	CAC	2	6	2527	2532	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_016618	CTC	2	6	2533	2538	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_016618	CCG	2	6	2547	2552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_016618	CCA	2	6	2662	2667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_016618	GGT	2	6	2671	2676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016618	GCC	2	6	2726	2731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_016618	GCCGG	2	10	2741	2750	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
70	NC_016618	GCG	2	6	2810	2815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_016618	GTC	2	6	2872	2877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_016618	CAG	2	6	2887	2892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_016618	CCCTT	2	10	2912	2921	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
74	NC_016618	CG	4	8	2951	2958	0 %	0 %	50 %	50 %	392383676
75	NC_016618	CGGT	2	8	2973	2980	0 %	25 %	50 %	25 %	392383676
76	NC_016618	GCC	2	6	3011	3016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392383676
77	NC_016618	CTCG	2	8	3079	3086	0 %	25 %	25 %	50 %	392383676
78	NC_016618	GCC	2	6	3121	3126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392383676
79	NC_016618	CCA	2	6	3147	3152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392383676
80	NC_016618	CCG	2	6	3255	3260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392383676
81	NC_016618	ATC	2	6	3263	3268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392383676
82	NC_016618	AGC	2	6	3324	3329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392383676
83	NC_016618	AGC	2	6	3338	3343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392383676
84	NC_016618	CGGC	2	8	3344	3351	0 %	0 %	50 %	50 %	392383676
85	NC_016618	CCG	3	9	3363	3371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392383676
86	NC_016618	CGG	2	6	3528	3533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392383676
87	NC_016618	TCG	2	6	3548	3553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392383676
88	NC_016618	GCGG	2	8	3556	3563	0 %	0 %	75 %	25 %	392383676
89	NC_016618	GC	3	6	3567	3572	0 %	0 %	50 %	50 %	392383676
90	NC_016618	CCT	2	6	3618	3623	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392383676
91	NC_016618	CCG	2	6	3753	3758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392383676
92	NC_016618	CG	3	6	3792	3797	0 %	0 %	50 %	50 %	392383676
93	NC_016618	CCA	2	6	3807	3812	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392383676
94	NC_016618	CAG	2	6	3864	3869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392383677
95	NC_016618	CGCC	2	8	3893	3900	0 %	0 %	25 %	75 %	392383677
96	NC_016618	GCCG	2	8	3924	3931	0 %	0 %	50 %	50 %	392383677
97	NC_016618	CAG	2	6	3969	3974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392383677
98	NC_016618	GAC	2	6	4026	4031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392383677
99	NC_016618	GGC	2	6	4055	4060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392383677
100	NC_016618	CCT	2	6	4070	4075	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392383677
101	NC_016618	CGCGG	2	10	4080	4089	0 %	0 %	60 %	40 %	392383677
102	NC_016618	GGTCG	2	10	4092	4101	0 %	20 %	60 %	20 %	392383677
103	NC_016618	ACC	2	6	4162	4167	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392383677
104	NC_016618	TGG	2	6	4193	4198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392383677
105	NC_016618	GGC	2	6	4247	4252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392383677
106	NC_016618	GC	3	6	4300	4305	0 %	0 %	50 %	50 %	392383677
107	NC_016618	CCAT	2	8	4315	4322	25 %	25 %	0 %	50 %	392383677
108	NC_016618	GTG	2	6	4335	4340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392383677
109	NC_016618	GTC	2	6	4344	4349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392383677
110	NC_016618	CGCGG	2	10	4398	4407	0 %	0 %	60 %	40 %	392383677
111	NC_016618	GCG	2	6	4431	4436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392383677
112	NC_016618	CGG	2	6	4488	4493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392383677
113	NC_016618	GCA	2	6	4496	4501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392383677
114	NC_016618	TGG	2	6	4592	4597	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392383677
115	NC_016618	GGC	2	6	4617	4622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392383677
116	NC_016618	GGC	2	6	4637	4642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392383677
117	NC_016618	GCG	2	6	4648	4653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392383677
118	NC_016618	ATC	2	6	4687	4692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392383677
119	NC_016618	TCG	2	6	4714	4719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392383677
120	NC_016618	CGG	2	6	4760	4765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392383677
121	NC_016618	GC	3	6	4833	4838	0 %	0 %	50 %	50 %	392383677
122	NC_016618	GCA	2	6	4883	4888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392383677
123	NC_016618	CGG	2	6	4895	4900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392383677
124	NC_016618	CGA	2	6	4919	4924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392383677
125	NC_016618	TCT	2	6	4940	4945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392383677
126	NC_016618	GCC	2	6	4998	5003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392383677
127	NC_016618	GGC	3	9	5055	5063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392383677
128	NC_016618	GCG	3	9	5082	5090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392383677
129	NC_016618	GTC	2	6	5094	5099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392383677
130	NC_016618	GCCGGG	2	12	5107	5118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392383677
131	NC_016618	CCT	2	6	5120	5125	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392383677
132	NC_016618	TGG	2	6	5137	5142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392383677
133	NC_016618	TGGA	2	8	5149	5156	25 %	25 %	50 %	0 %	392383677
134	NC_016618	GCGG	2	8	5225	5232	0 %	0 %	75 %	25 %	392383677
135	NC_016618	GTC	2	6	5259	5264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392383677
136	NC_016618	GGC	2	6	5271	5276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392383677
137	NC_016618	CGG	2	6	5321	5326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392383677
138	NC_016618	GCC	3	9	5349	5357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392383677
139	NC_016618	C	6	6	5356	5361	0 %	0 %	0 %	100 %	392383677
140	NC_016618	CTCGGC	2	12	5397	5408	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	392383677
141	NC_016618	ACC	2	6	5542	5547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392383677
142	NC_016618	GCC	2	6	5563	5568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392383677
143	NC_016618	GATG	2	8	5606	5613	25 %	25 %	50 %	0 %	392383677
144	NC_016618	CGC	2	6	5654	5659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392383677
145	NC_016618	TCG	2	6	5704	5709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392383677
146	NC_016618	CATG	2	8	5720	5727	25 %	25 %	25 %	25 %	392383677
147	NC_016618	GCG	2	6	5775	5780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392383677
148	NC_016618	CGC	2	6	5810	5815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392383677
149	NC_016618	CCCT	2	8	5910	5917	0 %	25 %	0 %	75 %	392383678
150	NC_016618	TCG	2	6	5922	5927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392383678
151	NC_016618	CG	3	6	5930	5935	0 %	0 %	50 %	50 %	392383678
152	NC_016618	GGCG	2	8	5938	5945	0 %	0 %	75 %	25 %	392383678
153	NC_016618	CCG	2	6	5953	5958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392383678
154	NC_016618	CGT	2	6	5974	5979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392383678
155	NC_016618	GC	3	6	5990	5995	0 %	0 %	50 %	50 %	392383678
156	NC_016618	CGC	2	6	6017	6022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392383678
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159	NC_016618	CCG	3	9	6088	6096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392383678
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161	NC_016618	CGG	3	9	6133	6141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392383678
162	NC_016618	CCG	2	6	6151	6156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392383678
163	NC_016618	GCG	2	6	6167	6172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392383678
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171	NC_016618	CAC	2	6	6332	6337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392383678
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173	NC_016618	TGG	2	6	6379	6384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392383678
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179	NC_016618	TCG	2	6	6661	6666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
180	NC_016618	GGT	2	6	6696	6701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392383679
181	NC_016618	CCG	2	6	6761	6766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392383679
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230	NC_016618	TCT	2	6	8301	8306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
231	NC_016618	TGA	2	6	8331	8336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392383680
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244	NC_016618	ACG	2	6	8894	8899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392383680
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249	NC_016618	AGC	2	6	9084	9089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392383680
250	NC_016618	GCT	2	6	9093	9098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392383680
251	NC_016618	CGC	2	6	9099	9104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392383680
252	NC_016618	ATG	2	6	9191	9196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392383680
253	NC_016618	CGCC	2	8	9213	9220	0 %	0 %	25 %	75 %	392383680
254	NC_016618	CTC	2	6	9277	9282	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392383680
255	NC_016618	CTC	2	6	9328	9333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392383680
256	NC_016618	CGG	3	9	9363	9371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392383680
257	NC_016618	CCG	2	6	9387	9392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392383680
258	NC_016618	GCT	2	6	9423	9428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392383680
259	NC_016618	TCCC	2	8	9450	9457	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
260	NC_016618	GGGA	2	8	9500	9507	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
261	NC_016618	TCCCC	2	10	9513	9522	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
262	NC_016618	CCACCG	2	12	9577	9588	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	392383681
263	NC_016618	CGC	3	9	9598	9606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392383681
264	NC_016618	CGC	2	6	9625	9630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392383681
265	NC_016618	TTC	2	6	9642	9647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392383681
266	NC_016618	GCC	2	6	9654	9659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392383681
267	NC_016618	AGC	2	6	9660	9665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392383681
268	NC_016618	GATGG	2	10	9695	9704	20 %	20 %	60 %	0 %	392383681
269	NC_016618	GC	3	6	9709	9714	0 %	0 %	50 %	50 %	392383681
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385	NC_016618	CGA	3	9	13929	13937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
386	NC_016618	GGC	2	6	13963	13968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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389	NC_016618	TGG	2	6	14017	14022	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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391	NC_016618	AGC	2	6	14124	14129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
392	NC_016618	GGT	2	6	14147	14152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
393	NC_016618	GAC	3	9	14153	14161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
394	NC_016618	CTC	2	6	14228	14233	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
395	NC_016618	CAC	2	6	14234	14239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
396	NC_016618	CGG	2	6	14284	14289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
397	NC_016618	GGC	2	6	14306	14311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
398	NC_016618	GC	4	8	14334	14341	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
399	NC_016618	GCC	2	6	14357	14362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
400	NC_016618	GGA	2	6	14384	14389	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
401	NC_016618	TCG	2	6	14406	14411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
402	NC_016618	GAT	2	6	14423	14428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
403	NC_016618	GCG	2	6	14475	14480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
404	NC_016618	CGG	2	6	14512	14517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
405	NC_016618	CGG	2	6	14566	14571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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407	NC_016618	CGC	3	9	14608	14616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
408	NC_016618	CG	3	6	14640	14645	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
409	NC_016618	CCGTG	2	10	14659	14668	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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411	NC_016618	GCC	2	6	14716	14721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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